Il nuovo museo è un faro contemporaneo. La sua forma richiama l'onda del mare, la cui trasparenza lascia intravedere la carena lignea di una nave appesa al suo interno, quale simbolo della tradizionale carpenteria finlandese.

Si propone la suddivisione dell'edificio in tre parti: un basamento in cemento armato rivestito con lastre di granito nero finlandese; un guscio trasparente sostenuto da portali metallici; una struttura appesa rivestita in legno conservata all'interno del suddetto guscio. L'utilizzo di materiali locali, contribuisce a ridurre l'impronta ecologica della produzione e del trasporto.

Lo spazio pubblico di fronte all'ingresso del museo è l'arrivo e la partenza dei percorsi ciclo-pedonali che provengono da tutte le direzioni. L'edificio è caratterizzato da una forma slanciata che lo proietta verso il mare e la città storica. Lo spazio antistante l'ingresso è una zona adatta ad ospitare installazioni temporanee. Il nuovo museo si pone come il nuovo propulsore di attività urbane e agisce come collettore delle rotte ciclo-pedonali.

L' ingresso principale del museo si trova in asse con Etelamakasiinikatu, lasciando però libera la vista verso la baia. L'ingresso VIP e quello per il personale e il carico/scarico merci sono collocati lungo la nuova strada, parallela a Laivasilankatu. I negozi e il ristorante sono accessibili anche lungo la banchina e mentre l'accesso di servizio alla cucina è posto sotto la piazza scultura, sul lato sud. Il visitatore è guidato da una rampa dolce attraverso un percorso ascendente fino alle gallerie all'interno della carena. Al primo piano la vista si spalanca sul porto. Dall'ingresso si vedono i servizi, i negozi e l'area pranzo, godendo della splendida vista sulla baia Etelasatama. Il bar e il ristorante sono collegati tra loro da un giardino d'inverno.

Gli spazi espositivi sono posti in continuità spaziale lungo l'intero edificio. Essi sono progettati per garantire la massima flessibilità attraverso l'uso di pareti mobili. La zona multiuso si sviluppa su doppia altezza: integrata con l'atrio è visibile da diversi punti. La sala conferenze è posta al primo piano, sopra l'ingresso principale. I sedili che l'attrezzano sono facilmente smontabili e riponibili negli spazi previsti collocati ai lati, vicino agli spogliatoi. Il palco inoltre può scorrere sotto il pavimento del laboratorio.

I due piani dell'edificio amministrativo sono collegati al museo da un "spina dorsale" centrale di servizi composta dalle scale, dai montacarichi e dai WC. La progettazione e la distribuzione degli spazi è pensata in modo da facilitare la logistica e la manutenzione degli stessi, e anche per consentire una corretta fruizione del museo da parte di persone portatrici di handicap.

Il nuovo Maksiini Terminal a due piani è perfettamente integrato con il museo e disegna assieme ad esso la piazza per le sculture,

accessibile sia dal lungomare che dal parco Tahtitornivuori per mezzo di un ponte ciclo-pedonale che approda sulla copertura panoramica del teminal.

Il museo segue gli standard Passivhaus, LEED e quelli europei NZEB, il che implica trasmittanze termiche per superfici opache non superiore a 0,1 W / m2K, e per le superfici trasparenti non superiori a 0,4 W / m2K; ermeticità ACH non superiore a 0,4 vol / h.

Il sistema di condizionamento invernale ed estivo sfrutta l'energia geotermica prodotta dalle sonde collocate nella struttura di fondazione a pali.